Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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