Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIC2Q96JB3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms