Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ATG4DQ86TL0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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