Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms