Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms