Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ECM1Q16610 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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