Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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GABRA6Q16445 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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