Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VPS72Q15906 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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VPS72Q15906 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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VPS72Q15906 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS72Q15906 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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