Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRKQ15262 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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