Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 KRTAP4-11-201ENST00000391413 1180 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR2A7-201ENST00000493325 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CASC9-201ENST00000504531 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NUDT19P5-201ENST00000505620 569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR4A9P-201ENST00000526326 944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC010595.1-201ENST00000507387 1453 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC079988.1-201ENST00000432984 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C14orf2-208ENST00000554713 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB1Q02641 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms