Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC42EP1Q00587 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms