Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCA2P51531 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms