Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms