Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRAFP15056 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRAFP15056 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms