Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRTO14522 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PTPRTO14522 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRTO14522 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21■□□□□ 0.95
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