Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms