Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPIFA1Q9NP55 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPIFA1Q9NP55 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPIFA1Q9NP55 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPIFA1Q9NP55 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPIFA1Q9NP55 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPIFA1Q9NP55 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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