Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RMDN1Q96DB5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms