Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM208BQ5VWN6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms