Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTP4A2Q12974 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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