Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FOXF2Q12947 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms