Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms