Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM38O00635 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM38O00635 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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