Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HDGFL3Q9Y3E1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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