Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PALD1Q9ULE6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms