Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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