Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms