Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms