Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA9Q16790 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms