Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CDSNQ15517 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CDSNQ15517 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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