Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms