Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEK3P51956 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEK3P51956 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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