Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms