Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IL3RAP26951 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms