Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms