Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-1B6SEH8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms