Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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