Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms