Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDXQ7Z353 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms