Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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