Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SSPNQ14714 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SSPNQ14714 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SSPNQ14714 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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