Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVS71-1P61550 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms