Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP4P49662 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP4P49662 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP4P49662 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms