Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CASQ1P31415 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASQ1P31415 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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