Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms