Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALUO43852 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CALUO43852 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CALUO43852 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CALUO43852 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CALUO43852 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms