Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHKBQ9Y259 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms