Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF346Q9UL40 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms