Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINGO1Q96FE5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms