Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC12Q8WUD4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms